La Unad cuenta con cuatro subsistemas estratégicos de la organización, visibles desde una Estructura Organizacional compuesta por unidades misionales y de gestión, como se visualiza en la imagen Estructura Organizacional Unad, y que corresponden a:

1. Subsistema de alta política universitaria: representado en el alto gobierno de la universidad, responsable de la definición y formulación de las políticas y planes institucionales. Visible en el Consejo Superior Universitario, el Consejo Académico y el Rector.
2. Subsistema de Dirección Estratégica: relativo al ámbito estratégico, responsable de definir de criterios, diseñar, organizar y direccionar estrategias que soporten la puesta en marcha de políticas y planes institucionales. Esta representado en las Vicerrectorías, la Secretaria General y las Oficinas Asesoras.
3. Subsistema de Gestión, Coordinación y Ejecución: relacionado con el ámbito operacional, responsable del desarrollo, autorregulación y evaluación integral de los procesos derivados de los planes y proyectos institucionales y son responsables las Direcciones Zonales, Direcciones de CEAD, Consejos de Escuela y Gerencias.
4. Subsistema de Asistencia y Apoyo Técnico a la Gestión: correspondiente al ámbito operativo, responsable del soporte académico, administrativo, técnico y logístico de los diferentes planes y proyectos. Lo conforman diferentes equipos contingentes de apoyo definidos por la Rectoría.

Documentos soportes:

• Decreto 2770 de Agosto 16 de 2006, por el cual se transforma en ente autónomo a la Universidad Nacional Abierta y a Distancia, UNAD
• Resolución 2660 de diciembre 18 de 2008, distribución geográfica de Ceads y zonas que conforman la Unad.
• Acuerdo No. 006 del 5 de Octubre de 2006, por el cual se expide el Estatuto Organizacional de la Unad en Colombia.